台南市长赖清德曾经因为治水预算、财划法等

台南市长赖清德曾经因为治水预算、财划法等，多次杠上中央政府，重批政府重北轻南；总统马英九南下主持「台86线」通车典礼时举出诸多实例反驳，赖清德在会后接受媒体访问时表示，总统举的例子有些失真，且南部民众并未感受到实质的成果，但对于总统释出善意，应该给予鼓励。
马英九与赖清德两人在台86线东西快速公路全线通车仪式上，有点互别苗头的意味。
赖清德在致词时特别针对中研院南部分院设置在高铁特定区、衔接台17线与台61线的跨安平港大桥、及衔接南科园区的工程计划等建议当面向总统请求支持。交通部长叶匡时则于简报时对于这些建议案一一回应，除了跨安平港大桥需要再研议之外，另2项都已核定，简报中数度提到马总统上任后很重视台南市的交通建设，计划经费超过新台币800亿元。
轮到马总统致词时开宗明义就说，叶部长的说明是他指示的，一定要让民众知道政府施政没有重北轻南，因为6年前造访台南时，曾听到民众抱怨交通建设不足；上任后除了规划台南升格为直辖市，上任至今核定投入台南市的交通建设经费约893亿元，比前任总统核定的多出3.5倍，强调自己是一位说话算话的人，而且还对比前总统陈水扁台南人的身份。「我不是台南人，但我非常重视台南，不管我是台北市长或是总统，我对乡亲的承诺一定做到」
赖清德则在会后对此回应，「马总统提及的预算数字有失真，何况民众并未看到实质的成果，南部民众感受上仍没有平衡的感觉，不过总统愿意这么做就该给他肯定。」
赖清德上任后曾经多次针对治水预算、财划法等呛过中央，马总统此回显然是有备而来。